Pondok Pesantren Al-Amanah Al-Gontory dengan mengemban visi dan misi pendidikan, mencerdaskan kehidupan masyarakat dan bangsa. Melalui system pendidikan berasrama 24 jam, santri dididik agar tumbuh berakhlak mulia, berpengetahuan luas, terampil dan bermanfaat bagi diri dan masyarakatnya. Santri adalah pemimpin masa depan, tumbuh dalam lingkungan berpendidikan yang nyaman dan asri, santri dididik, dibina, diasuh, juga dibekali wawasan serta ilmu pengetahuan agama dan umum secara terpadu. Tak terkecuali beragam ketrampilan kecakapan hidup-life skilld santri pun turut ditumbuhkan-kembangkan, sehingga nantinya santri berjiwa mandiri,kelak di masyarakat, saatnya santri berdaya saing tinggi, maka Pondok Pesantren Al-Amanah Al-Gontory Panca Jiwa dan Motto sebagi berikut :

Panca Jiwa Pondok Pesantren Al-Amanah Al-Gontory

1. Keikhlasan
2. Kesederhanaan
3. Berdikari
4. Ukhuwah Islamiyah
5. Kebebasan

Motto Pondok Pesantren Al-Amanah Al-Gontory

1. Berbudi Tinggi
2. Berbadan Sehar
3. Berpengetahuan Luas
4. Berpikiran Bebas